研究报告
甜叶菊 EST 序列特征分析与分子标记开发 
盛文涛* 
,
邓建兰 
,
饶友生 ,
柴学文 ,
邹鑫
,
邓建兰 ,
饶友生 ,
柴学文 ,
邹鑫
南昌师范学院, 生物技术研究所, 南昌, 330032
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 27 篇
收稿日期: 2018年05月15日 接受日期: 2018年06月10日 发表日期: 2019年08月28日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 27 篇
收稿日期: 2018年05月15日 接受日期: 2018年06月10日 发表日期: 2019年08月28日
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摘要
为了明确甜叶菊 EST 序列中 SSR 的总体特点，开发甜叶菊 EST-SSR 分子标记，为利用 EST-SSR标记开展甜叶菊分子遗传研究提供科学依据。本研究从 NCBI 数据库中下载获得了 5 646 条 EST 序列，利用在线软件 SSRtool 和 Websat 检测所含 SSR 位点进行分析。结果共检索出 88 个 SSR 位点序列，分布于 79 条EST 序列中，检出率为 1.6%。其中，六核苷酸重复基元的 EST-SSR 占主导地位，占总 SSR 数目的 63.7%。利用在线软件 Primer 3.0 设计了 62 对 EST-SSR 引物，经筛选验证获得了多态性较好的引物 32 对，表明通过甜叶菊 EST 序列开发 SSR 标记是可行的。
关键词
甜叶菊；NCBI；多态性；EST-SSR
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